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原子吸收光譜分析中的光譜干擾較原子發射光譜要少得多。理想的原子吸收，應該是在所選用的光譜通帶內僅有光源的一條共振發射線和波長與之對應的一條吸收線。當光譜通帶內多于一條吸收線或光譜通帶內存在光源發躬垢非吸收線時，靈敏度降低且工作曲線線性范圍變窄。當被測試液中含有吸收線相重疊的兩種元素時，無論測哪一種都將產生干擾。

光譜通帶內多于一條吸收線

如果在光譜內存在光源的幾條發射線，而且被測元素對這幾種輻射光均產生吸收，這就產生干擾。也就是所謂的多重譜線干擾，以過渡元素較多。

若多重吸收線和主吸收線波長差不是很小時，通過減小狹縫來克服多重譜線的干擾。但波長差很多小時，通過減小狹縫仍難消除干擾，并且可能使信噪比大大降低，此時需別選譜線。

光譜通帶內存在光源發射的非吸收線

待測元素的非吸收線出現在光譜通帶內，這非吸收線可以是待測元素的譜線，也可能是其它元素的譜線.此時產生的干擾使靈敏度降低和工作曲線彎曲。造成這種干擾的原因有幾種：

1、具有復雜光譜的元素本身就發射出單色器難以分開的譜線;

2、多元素空芯陰極燈因發射線較復雜而存在非吸收干擾;

3、光源陰極材料中的雜質所引起的非吸收干擾;

4、光源填充的惰性氣體的輻射線引起的非吸收干擾。

克服這種干擾常用方法是減小狹縫寬度，使光譜通帶小到步以分離掉非吸收線但使信噪比變壞。這時可以改用其它分析線，雖靈敏度較低，但允許較大的光譜通帶，有利于提高信噪比。